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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于表面抗原种类特女性朋友、寡核苷酸绘制成本价慷慨激昂或工作工作流程僵化。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯教导拜谱生物在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个低利润、跨外来物种、全软件兼容的全新解决方案。

杂志详细介绍

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由全国人小学科工程海瑞朗基因隔代遗传病基因与发肓生物工程工程工程学探讨所和全国人基因隔代遗传病基因懂得主办人的国际级科研性刊物,专业专注于新闻报导人身安全小学学科和中医药学基因隔代遗传病基因学论述方向的创作者性探讨效果。JGG 2028年度影晌指数公式7.1,Scopus科研性刊物评论公式CiteScore 9.9,排名第JCR 2028年度GENETICS & HEREDITY论述方向Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY论述方向Q1区,排名第全国人小学科工程海瑞朗刊物系统盘生物工程工程工程学大类目1区(Top刊物),基因隔代遗传病基因学和血生化与团伙生物工程工程工程学小类双1区。

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啥是HEATag

委婉的“二一体化”的设计

HEATag是由凝集素和HUH内切酶组成的交融蛋清

「分析器」板块 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化突显(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「连到器」模块图片 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)引索方形码完成共价相连。

“1+1>2”的的效果:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行样本量标示与产品追溯。

Fig1: HEATag强有力的加密管控标注方式示意向图

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进阶篇检定

HEATag真不知道有能开打?

能够 在各种不同状态下,实现目标辅乳昆虫组织人体细胞系单组织人体细胞混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。探析的团队为 HEATag 安装了多轮 “各种压力试验”,从组织系到组织核,从常温的到低温环境,从新鲜模板到固定不变模板,全东南方向手机验证它的稳确定高性和是真的吗性。

最轮检查而对辅乳软体动物体癌细胞膜系:研发工作人员考虑了源于人、鼠、仓鼠5个外来种类的两种体癌细胞膜(HEK293T、K562、MEF、CHO),在高温使用 HEATag 标志后搭配测序。结果英文收购 的 11447 个体癌细胞膜中,85.66% 都能按照 HEATag 长形码精准的适合到原外来种类,模本间双向被污染很少,UMAP 聚类深入分析法深入分析无论是会说明,HEATag 长形码与外来种类特男人基因组组优点的高度一样。 然后接着,自测能力进那步升极:研究分析职工体验在 4℃下图标剥好癌生殖组织体上皮细胞、在常温下图标甲醇进行进行固定癌生殖组织体上皮细胞,甚至会会直接图标癌生殖组织体上皮细胞。数据照样完美:很多能力下,子模板标签贴与外来物种消息均极具挺好的有关的性,分拆确切率超 95%。纵然甲醇进行进行固定会产生轻微的的转录本交叉性污染问题,癌生殖组织体上皮细胞制取会多量 RNA 浪费,癌生殖组织体上皮细胞种类的标注数据照样与剥好子模板长期保持完全一致,证明怎么写 HEATag 还可以图标不一样的正确处理能力下的实验室子模板。

Fig2: HEATag 可在不一样的必备条件下完毕单体细胞转录组混样浅析

可符号辅乳期植物和海域无脊柱植物的原代血细胞

一旦说细胞膜系系测试软件是 “知识基础题”,那结构样版量只是 “扣减题”, 等等样版量一般情况下因细胞膜系款式比较复杂、环镜认知性特别,成為标志技术工艺的 “关键问题”,而 HEATag 刚好在等等 “关键问题” 上体现出了优势与劣势。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸团队,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞不单单能被最准确鉴别,所有主要的細胞种类的聚类分析结果显示都清新可辨。

更令人惊喜的是HEATag对海洋菌物菌物的支持性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 长形码与种群转录组兼具较高同步性,未诞生因高盐环境造成的 “标识报废”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可达到哺乳期部分动物组织结构样版多大 scRNA-seq 研究

Fig4: HEATag可达到最新海洋资源无脊柱软体动物众多 scRNA-seq 剖析

HEATag与细胞核的依照不所致转录组的有明显优化

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在完毕图标目标任务的互相,也不会对事后的转录成分析导致的打扰,保障了研究方案数据报告的完美性。

Fig5: HEATag不关系样本量的 RNA 表达出玩法

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发展可期

HEATag 能为单受损细胞科研介绍什么样的?

HEATag 的作用,远不尽于 “来解决记号毛病”,它的灵活多变性和共通性,已经在为单人体细胞研发另存大量很有更多可能性

从技术应用游戏场景来说

HEATag 能覆盖住从 “简易十分分折”(如癌集体发展与健康集体发展、药品处里与较)到 “大小性学习探讨”(如集体发展神经生殖细胞图谱设计、高通骁龙量筛分)的全范围图业务需求。发生变化 PIP-seq、Stereo-cell 等创新可优化水平的未来发展,HEATag 还能进一部不断提升单神经生殖细胞学习探讨的通量,帮助科技创新团对发展更大小性的楼盘。

从跨行业领域竟争力看下

HEATag 不仅能可用到于转录组学,还能与表观DNA组学、蛋清质组学、位置组学等新高技术推向,能够 通过定制开发数据库索引和寡核苷酸队列,HEATag 能够 快速推向有差异的组学步奏,不损害卫星信号捕捉淬硬层。的同时,研究分析背景HEATag还能够 不断发展单神经元糖组学研究分析新高技术。

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合作共赢动态图

拜谱生物体与陈凯老师已达成过程联合意向性

比较适合关注新闻的是,在 HEATag 方法体流露出庞然大物操作成长性的背景图下,拜谱海上生态学已与男方海上科学调查与建设工程全国科学检测调查室(汕头)陈凯硕士生导师确定大概达成合作有意向的。夫妻双方进度表把握 HEATag 方法的流通业化出台、科研管理开发办公导出等位置生成淬硬层协同,推动某些低投资成本、跨鱼类的单肿瘤血细胞系箭头方法最快操作于事实科研管理开发办公不一样,为更加多科学检测调查室给予高、经济社会的单肿瘤血细胞系探析平台,保驾护航科研管理开发办公办公者在肿瘤血细胞系海上生态学学、海上海上生态学学、常见疾病考核机制等教育领域得到更加多突破自我
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