
2024年9月由成都绿植基地大学生张万刚传授技术团队在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱菌物为该研究提供了亚硝基化绘制组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
中文翻译问题:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
期刊论文:Journal of Agricultural and Food Chemistry
2023年导致分子:5.7
收录精力:2024年9月
客人企业:南京农业大学
探析材质:蛋白
拜谱可以提供技术工艺:亚硝基化修饰组学
技术水平的路线:
一、科学研究毕竟
01.Caspase-3特异性
现在尚不模糊NO对caspase-3的缓和效果会不会归因于NO介导的S-亚硝基化,其他浓度值均值的GSNO成为外源性NO现货供应,以帮助caspase-3的体内S-亚硝基化。成果反映,与不存在GSNO的组不同于,100、200和400μM GSNO组的caspase-3渗透性显著性大大减少(图1),与原先有关报道同一。GSNO整理大大减少caspase-3渗透性的内在的缘由仍亟需说明。
图1 各种不同密度的GSNO处置对caspase-3几丁质酶的干扰
02.Caspase-3的S-亚硝基化层面
实验Caspase-3的亚硝基化状态上,以阐释GSNO对Caspase-3的化学反应性。经GSNO工作后,检则到caspase-3血清S-亚硝基化比强度延长(图2)。许多结杲显示,外源性GSNO培植可取得胜利诱发caspase-3的离体S-亚硝基化。另人吃惊的是,在没得GSNO普遍存在的比组中检则到一款衰弱的S-亚硝基化带,这显示caspase-3机会出现内源性的S-亚硝基化。另外,本实验中caspase-3的S-亚硝基化状态上较高,而caspase-3的灵活性削减,这与以往的实验相一致。其实,caspase-3的特女性朋友S-亚硝基化绘制位点尚不模糊不清,还是需要进这一步的打磨。
图2 GSNO加工对caspase-3S-亚硝基化平行的反应
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化掩盖组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的队列。暗蓝色记号的队列表述S-亚硝基化肽,颜色记号的C表述S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱分析
04.S-亚硝基化Caspase-3吸附结球蛋白
结蛋清充当另外一种至关重要性的細胞骨架蛋清,在保持肌細胞型式的型式系统性和收敛性等方面起着重于要性帮助,科研S-亚硝基化caspase-3对结蛋清挥发的敏情绪化性极具至关重要性效果。与Std(未用胱天蛋清酶-3和GSNO孵育的起始肌食物纤维素蛋清)组好于,0 μM GSNO组(肌原食物纤维素和caspase-3的孵育,无GSNO)的系统结蛋清份量重要大大减少,显示caspase-3对结蛋清极具隐性的蛋清电离效率。在GSNO孵育后,系统结蛋清的份量看不出扩大(P < 0.05)。另外,当GSNO密度身高时,系统结蛋清的份量持续保持调涨(P < 0.05)(图5)。某些发展认为,SNO淡化的caspase-3以横向依靠的方式减缓结蛋清的挥发。
图5.S-亚硝基化caspase-3挥发结蛋白酶
05.S-亚硝基化Caspase- 3吸附肌钙核蛋白-T
肌钙蛋清质-T (TnT)是原肌球蛋清质调低管理胸肌收縮的细细的的有必须肌原玻璃氯纶蛋清质。TnT的吸附症状是查测到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化先决条件下,caspase-3对TnT的吸附现状右图6如图,与Std组(含有caspase-3和GSNO的肌原玻璃氯纶)相比之下,caspase-3组中30 kDa TnT情节取得新增,阐明caspase-3体验了TnT的吸附,最后,caspase-3与GSNO的孵育使得30 kDa TnT骤降。在100和200 μM GSNO组左右还没有查测到很大的对比(P > 0.05),而当GSNO的密度达成400 μM 时,该情节取得少(P < 0.05)。等等看见阐明了SNO呈现的caspase-3对TnT吸附的仰加工制做用。结蛋清质和TnT是caspase-3的敏感性底物,而GSNO补救较低caspase-3的活力性已经使得肌原玻璃氯纶蛋清质吸附数量较低。上述情况所诉,NO诱惑的S-亚硝基化也可以使用呈现半胱氨酸残基来调低caspase-3的活力性,随之进步导致其对结蛋清质和TnT的蛋清质电离意识,因此导致羊肉品性。
图6. S-亚硝基化caspase- 3溶解肌钙蛋白质-T
二、工作小结
本的研究目的在于探析S-亚硝基化对caspase-3突显的不良影响力非常马上又对羊肉肌原仟维身体外化学降解的不良影响力。核蛋白质酶S-亚硝基化也可以突显caspase-3的半胱氨酸残基,因此引发caspase-3活性酶拉低,进1步促使了其对羊肉肌原仟维核蛋白质酶的核蛋白质酶淀粉水解性能。三、拜谱工作小结
的学习主要包括了酶活校正,亚硝基化突显组学学习分析,WB等判断伎俩,看见核蛋清酶酶S-亚硝基化可突显caspase-3的半胱氨酸残基,这使得了caspase-3化学活化的有效降低,相结三步抑止了其对牛羊肉肌原仟维核蛋清酶酶的核蛋清酶酶电离效果。本的学习为解釋核蛋清酶酶质亚硝基化对色泽的调节机能提供了好几回个新的的视野。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的营养物质质组学、突显营养物质质组学、排泄组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸全系列好产品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺硝化作用、total脱色还原系统、分散巯基,欢迎大家咨询!
考虑毕业论文:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663